臺南市政府財政稅務局表示：依照房屋稅條例第3條規定，房屋稅係以附著於土地之各種房屋，及有關增加該房屋使用價值之建築物，為課徵對象；對於違章建築房屋自不例外，是無照違章建築在未拆除前均應設籍課稅，違章建築繳納房屋稅僅是屬於納稅義務的履行，在未經建築主管機關審查許可並核發執照前，仍是屬於不合法的建築物，是吳小姐雖都有按時繳納房屋稅，依上所示仍是不合法房屋，無法至地政機關辦理保存登記。 該局指出：如對違章房屋不予設籍課稅，不僅增加稅籍管理及計徵遺產稅之困難，而且對合法房屋而言，更有失公平或將發生反效果，助長違建之風，為求課稅公平及健全稅籍起見，對於違章建築房屋，均應依法設籍為宜。
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